Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Hes3Q61657 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hes3Q61657 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Hes3Q61657 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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