Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms