Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms