Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms