Protein–RNA interactions for Protein: Q61122

Nab1, NGFI-A-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab1Q61122 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms