Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms