Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms