Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm1Q60636 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms