Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms