Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms