Protein–RNA interactions for Protein: Q497K7

Tmem247, Transmembrane protein 247, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem247Q497K7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem247Q497K7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem247Q497K7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms