Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b4Q3V0X2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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