Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm5aQ3UXZ9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms