Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms