Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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H2-Eb2Q3UUV9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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H2-Eb2Q3UUV9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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H2-Eb2Q3UUV9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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H2-Eb2Q3UUV9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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H2-Eb2Q3UUV9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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H2-Eb2Q3UUV9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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H2-Eb2Q3UUV9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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H2-Eb2Q3UUV9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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H2-Eb2Q3UUV9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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