Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms