Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28047Q3US59 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms