Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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Znf48Q3US17 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Znf48Q3US17 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms