Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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