Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms