Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp30Q3UN04 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Usp30Q3UN04 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp30Q3UN04 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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