Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms