Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxosQ3UL53 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CrxosQ3UL53 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms