Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcgf5Q3UK78 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms