Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpr55Q3UJF0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gpr55Q3UJF0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gpr55Q3UJF0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gpr55Q3UJF0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gpr55Q3UJF0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gpr55Q3UJF0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpr55Q3UJF0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpr55Q3UJF0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpr55Q3UJF0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpr55Q3UJF0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpr55Q3UJF0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpr55Q3UJF0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpr55Q3UJF0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpr55Q3UJF0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpr55Q3UJF0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpr55Q3UJF0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpr55Q3UJF0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpr55Q3UJF0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpr55Q3UJF0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpr55Q3UJF0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gpr55Q3UJF0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms