Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp19Q3UJD6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms