Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf224Q3UIW8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf224Q3UIW8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms