Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garem1Q3UFT3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms