Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 9930120I10Rik-201ENSMUST00000203027 865 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam117bQ3U3E2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms