Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gse1Q3U3C9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms