Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms