Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TchpQ3TVW5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TchpQ3TVW5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TchpQ3TVW5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TchpQ3TVW5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TchpQ3TVW5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TchpQ3TVW5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TchpQ3TVW5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TchpQ3TVW5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TchpQ3TVW5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TchpQ3TVW5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TchpQ3TVW5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms