Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
XylbQ3TNA1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms