Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc102aQ3TMW1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc102aQ3TMW1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc102aQ3TMW1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc102aQ3TMW1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc102aQ3TMW1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc102aQ3TMW1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc102aQ3TMW1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc102aQ3TMW1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc102aQ3TMW1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc102aQ3TMW1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc102aQ3TMW1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc102aQ3TMW1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc102aQ3TMW1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc102aQ3TMW1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms