Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sppl2bQ3TD49 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2bQ3TD49 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms