Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tmem248Q3TBN1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tmem248Q3TBN1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tmem248Q3TBN1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tmem248Q3TBN1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tmem248Q3TBN1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tmem248Q3TBN1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tmem248Q3TBN1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmem248Q3TBN1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmem248Q3TBN1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmem248Q3TBN1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmem248Q3TBN1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmem248Q3TBN1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmem248Q3TBN1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmem248Q3TBN1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Tmem248Q3TBN1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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