Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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