Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3KNL4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3KNL4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3KNL4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3KNL4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3KNL4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3KNL4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3KNL4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3KNL4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms