Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp1aQ2LKU9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrp1aQ2LKU9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms