Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Fgfbp3Q1HCM0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fgfbp3Q1HCM0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms