Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Ttc39dQ0VF76 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Ttc39dQ0VF76 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Ttc39dQ0VF76 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Ttc39dQ0VF76 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Ttc39dQ0VF76 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Ttc39dQ0VF76 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Ttc39dQ0VF76 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Ttc39dQ0VF76 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ttc39dQ0VF76 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ttc39dQ0VF76 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ttc39dQ0VF76 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms