Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zc3h18Q0P678 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms