Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrriq1Q0P5X1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms