Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neurl1bQ0MW30 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms