Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou6f1Q07916 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms