Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MestQ07646 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MestQ07646 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MestQ07646 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MestQ07646 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MestQ07646 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MestQ07646 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MestQ07646 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MestQ07646 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MestQ07646 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MestQ07646 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MestQ07646 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MestQ07646 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MestQ07646 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MestQ07646 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MestQ07646 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MestQ07646 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MestQ07646 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MestQ07646 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MestQ07646 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MestQ07646 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MestQ07646 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MestQ07646 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MestQ07646 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MestQ07646 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
MestQ07646 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MestQ07646 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
MestQ07646 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
MestQ07646 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MestQ07646 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MestQ07646 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MestQ07646 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
MestQ07646 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MestQ07646 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MestQ07646 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MestQ07646 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MestQ07646 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MestQ07646 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MestQ07646 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms