Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms