Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms