Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms