Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms